CECIRA V: CAPACITACIONES GANADORAS

Proyecto de Capacitación en el Uso de Herramientas Bioinformáticas y Aplicaciones Genómicas con BioConductor (en plataforma R)

Objetivo General: El objetivo del presente proyecto es capacitar a los investigadores ecuatorianos que realizan desarrollo e investigación en las áreas relacionados a la exploración y explotación de información genómica en análisis estadístico y computacional que permita la integración los distintos análisis de información en un solo sistema informático de uso libre como es BioConductor en plataforma R para el análisis e interpretación de datos genómicos.

Participantes:

  • Lenin Ron Garrido
  • Freddy Proaño Pérez
  • Richar Rodríguez

Organizadores:

  • UCE
  • ESPE

Áreas de investigación:

Genómica
Bioinformática
Genética
Epidemiología
Proteómica
Farmacología
Biotecnología Humana
Animal y vegetal
Sistemática y Filogenia
Microbiología

Contenidos:

Explicación del Sílabo y metodología
Introduction to R and Rstudio
Introduction to Expression Microarray Technology
Expression Microarray Preprocessing
Differential Expression Analysis for Microarrays
GSEA
Introduction to NGS
Quality Control
Alignment and Counting (Part I)
Alignment and Counting (Part II)
Differential Expression for RNA-Seq
Remainders of the week + Topics: GWAS / QTL
Evaluation
Elaboración de Manual BioConductor con aplicaciones Genómicas

Estado: En ejecución.